Цветок вечности: Дни Камогавы

События разворачиваются спустя некоторое время после завершения первого сезона. Ёко занимается подводными исследованиями в районе Мадагаскара. Мадока, которая больше не может активировать способность «глаз ауры», возвращается в Камогаву. Дома она находит письма от Лан и Мугинами, где они рассказывают о своей текущей жизни и поздравляют её с Новым Годом. Через несколько месяцев учебный год заканчивается, Мадока переходит в следующий класс, и приближается её день рождения.

В это же время её подруги прилетают в межгалактический туристический центр на планете Полигидрон, чтобы осмотреть копию города Камогавы. Их визит совпадает с подготовкой к празднованию дня рождения Мадоки. Сюжет строится вокруг параллельных линий: исследования Ёко, жизнь Мадоки в родном городе и путешествие подруг, чьи пути в итоге пересекаются.